微生物培養市場 規模・シェア分析 – 成長トレンドと予測 (2026年～2031年)

微生物培養市場の概要

本レポートは、微生物培養市場の規模、シェア、成長トレンド、および2026年から2031年までの予測について詳細に分析したものです。

市場規模と成長予測

微生物培養市場は、2025年に22.2億米ドルと評価され、2026年には23.2億米ドル、2031年には28.6億米ドルに達すると予測されており、予測期間（2026年～2031年）における年平均成長率（CAGR）は4.33%です。この成長は、精密発酵プラットフォームへの投資増加、医薬品グレード培養の需要拡大、主要な原材料供給業者間の統合、コールドチェーン物流の課題、および多様な規制枠組みによって推進されています。

競争上の優位性は、菌株ライブラリの深さ、バイオプロテクティブ機能、および食品・医薬品基準への二重適合性を市場投入の遅延なく達成する能力によって決定されます。地域別では、欧州が最大の収益貢献地域である一方、アジア太平洋地域は中国の発酵飲料市場の拡大とインドのプロバイオティクス乳製品への注力により、最も高い成長を遂げています。市場集中度は中程度です。

主要なレポートのポイント

* 製品タイプ別: 細菌培養が2025年に62.35%の市場シェアを占め、市場を牽引しました。一方、酵母培養は2026年から2031年にかけて6.74%の最速CAGRを記録すると予測されています。
* 用途別: 食品・飲料が2025年の収益の37.10%を占めましたが、栄養補助食品および医薬品は2031年までに7.29%のCAGRで拡大すると予測されています。
* 地域別: 欧州が2025年の売上高の31.65%を占めましたが、アジア太平洋地域は2026年から2031年の期間に5.74%のCAGRで微生物培養市場を牽引すると見込まれています。

世界の微生物培養市場のトレンドと洞察

市場牽引要因

1. プロバイオティクスが豊富な機能性食品への需要増加（CAGRへの影響：+1.2%）
* 消費者の腸内健康への関心の高まりが、乳製品および飲料ポートフォリオに大きな変化をもたらしています。プロバイオティクスヨーグルトやケフィアは、西欧の小売店で冷蔵乳製品の棚スペースの40%以上を占めています。免疫サポートのためのLactobacillus rhamnosus GGや消化器健康のためのBifidobacterium lactis HN019といった菌株特有の主張が、栄養補助食品から主流の食品製品へと移行しています。これにより、殺菌、低pHレベル、および長期保存に耐え、かつ有効性を維持できる培養の開発が不可欠となっています。また、培養サプライヤーは植物性食品ブランドとの共同開発契約を積極的に締結し、オート麦、大豆、エンドウ豆などの基質を発酵させても異臭を発生させない安定した費用対効果の高い菌株の作成に注力しています。欧州食品安全機関（EFSA）のQPSリストの2024年更新により、3つの新しいLactiplantibacillus種が追加されたことで、欧州での新製品承認プロセスが合理化され、市場投入までの時間が短縮されると期待されています。

2. 産業用バイオ医薬品発酵能力の拡大（CAGRへの影響：+0.9%）
* 世界のバイオ医薬品発酵能力の急速な拡大は、微生物培養市場の著しい成長を牽引しています。バイオ医薬品、ワクチン、抗体療法、組換えタンパク質が医薬品パイプラインを支配する中、大規模な微生物および哺乳類細胞発酵は産業用バイオプロセシングの重要な要素となっています。2024年には、受託開発製造機関（CDMO）が単回使用バイオリアクターの容量を前例のない速さで増加させ、世界中で50万リットル以上の新しい攪拌槽型バイオリアクター容量を追加しました。この拡大は、細胞培養培地の必須窒素源である細菌加水分解物、酵母エキス、ペプトンなどの微生物由来の投入物の需要を直接増加させています。

3. 食品・飲料業界におけるクリーンラベルの天然保存料への移行（CAGRへの影響：+0.8%）
* 規制変更と消費者の嗜好の変化により、食品・飲料業界では天然保存料としての微生物培養の使用が増加しています。欧州委員会の2024年の規則（EC）No. 1333/2008の改訂により、調理済みサラダ中の安息香酸ナトリウムの制限が厳しくなり、肉製品や焼き菓子中の亜硝酸塩および合成ソルビン酸塩の使用が制限されたことで、製造業者はクリーンラベルの代替品を模索するようになりました。IFIC 2024によると、消費者の11%がクリーンラベル成分を好むようになり、バクテリオシン、有機酸、抗真菌代謝物を製品内で直接生成するバイオプロテクティブ培養の需要が高まっています。これらの培養は、合成保存料と比較して1kgあたり0.02～0.05米ドル（15～25%のプレミアム）の追加コストがかかりますが、規制要件、小売業者基準、および消費者の嗜好に合致する能力により、世界中のクリーンラベル製品における微生物培養の重要な成長要因となっています。

4. 代替タンパク質のための精密発酵の急速な採用（CAGRへの影響：+0.7%）
* 代替タンパク質のための精密発酵の急速な拡大は、世界の微生物培養市場の重要な成長要因です。精密発酵は、酵母、細菌、糸状菌などの微生物宿主を利用して、一貫した品質とスケーラビリティを持つ高価値タンパク質成分、酵素、および生物活性化合物を生産します。持続可能で倫理的、機能的な動物性タンパク質の代替品を求める消費者の間で植物性および細胞培養タンパク質製品の人気が高まるにつれて、細菌加水分解物、酵母エキス、成長最適化菌株などの特殊な微生物培養の需要が増加しています。

市場の阻害要因

1. 厳格な規制承認（CAGRへの影響：-0.6%）
* 食品安全と医薬品グレードの承認経路間の相違は、特に小規模な培養サプライヤーにとって二重のコンプライアンス課題を生み出しています。EFSAのQPSフレームワークは確立された属のプロセスを簡素化しますが、新規菌株には全ゲノムシーケンスと抗菌薬耐性プロファイリングを依然として要求します。このプロセスは最近、LeuconostocおよびWeissellaの提出に18～24ヶ月かかり、30万～50万ユーロの費用が発生しました。その結果、サプライヤーは全く新しい種の開発よりも、承認された菌株の拡張に戦略的に注力しており、発酵植物性シーフードやプロバイオティクスペットフードなどの新たな用途に対応する業界の能力を制限しています。さらに、日本の厚生労働省は2024年に輸入培養に対する新しいトレーサビリティ要件を導入しました。

2. コールドチェーンへの高い依存が物流の複雑さとコストを増加（CAGRへの影響：-0.3%）
* 微生物培養の生存率は8℃を超えると急速に低下しますが、信頼性の低い冷蔵インフラを持つ地域では、最終配送中の温度変動が依然として一般的です。Journal of Food Protectionに掲載された2024年の研究では、東南アジア市場のプロバイオティクスヨーグルトサンプルの18%が、小売流通中のコールドチェーンの混乱により、治療効果のないコロニー数であったと報告されています。この脆弱性により物流コストが増加し、能動的な温度監視を伴う航空貨物輸送は、常温貨物と比較して1kgあたり2～4米ドルの追加費用が発生し、輸出志向のサプライヤーの利益率を40～60%削減します。その結果、周囲温度での保存に耐えることができる凍結乾燥（フリーズドライ）形式への戦略的移行が見られますが、食品メーカーはプロセスが複雑になるため、再水和プロトコルの採用に消極的です。しかし、凍結乾燥は生産コストを1kgあたり8～12米ドル増加させるため、栄養補助食品や医薬品プロバイオティクスなどの高利益率用途に限定されています。

セグメント分析

製品タイプ別：細菌培養の優位性と酵母培養の加速

* 細菌培養は2025年に微生物培養市場の62.35%を占め、伝統的な乳製品、野菜、肉の発酵において重要な役割を果たしています。Lactobacillus、Lactococcus、Streptococcus属の乳酸菌は、チーズやヨーグルトの生産に不可欠であり、NovozymesのFreshQ菌株は欧州の乳製品業界で大きな市場浸透を達成しています。Propionibacterium freudenreichiiは保存期間の延長とビタミンB12の強化に貢献し、LeuconostocとPediococcusはザワークラウトやサラミ生産などの局所的な用途で利用されています。
* 酵母培養は6.74%のCAGRで成長すると予測されており、ベーカリー製品におけるクリーンラベルのトレンド、クラフト醸造におけるフレーバーイノベーション、および第二世代バイオエタノール副産物における役割により、牽引力を増しています。細菌培養の市場規模は着実に成長すると予想されますが、非乳製品およびバイオエタノール用途の拡大に伴い、酵母培養が市場シェアの一部を獲得すると見込まれています。
* 複合培養は、植物性乳製品代替品において重要性を増しており、細菌、酵母、カビを単一の接種で統合し、これらの製品で伝統的な口当たりを実現するのに役立っています。

用途別：医薬品分野の急成長が食品分野の成熟を上回る

* 食品・飲料は2025年の収益の37.10%を占め、微生物培養市場を支配し続けています。食品セグメント内では乳製品が主要なカテゴリーですが、成熟した西欧経済圏では一人当たりのヨーグルト消費量が安定しています。
* この優位性にもかかわらず、栄養補助食品および医薬品は2031年までに7.29%のCAGRでより速い速度で成長すると予測されています。栄養補助食品の成長は、利便性と有効性に対する消費者の嗜好に応える、保証されたCFU数を持つ安定したプロバイオティクス形式への需要増加によって主に推進されています。
* 医薬品の生体治療製品は、FDAの2024年ガイダンスの下で実現可能となり、業界にとって重要な節目となりました。この規制の進展は、保険償還への道を開き、利益率を高める可能性がありますが、より厳格なコンプライアンス要件も課されます。
* 一方、動物飼料や農業を含む「その他」のカテゴリーは勢いを増しています。EUの予防的抗生物質禁止は、飼料変換率を改善するだけでなく、持続可能で抗生物質を使用しない農業慣行への注力と合致するバチルスベースの代替品の採用を奨励しています。

地域分析

* 欧州は2025年に微生物培養市場の31.65%を占め、パルミジャーノ・レッジャーノやロックフォールなどの伝統的なチーズに伝統的な培養の使用を義務付ける厳格な原産地呼称保護（PDO）規則に支えられています。ドイツ、フランス、イタリアは、高いチーズ消費量と加工肉製品におけるクリーンラベル要件の需要増加により、欧州の需要の60%以上を占めています。投資はプロバイオティクス飼料添加物にも集中しており、2030年までに抗菌薬使用量を50%削減するというEUグリーンディールの目標と合致しています。欧州の成熟した市場は量的な成長を制限しますが、バイオプロテクティブ肉培養、植物性乳製品代替品、精密発酵投入物において漸進的な進歩が見られます。
* アジア太平洋地域は、中国の発酵飲料市場の拡大、インドのヨーグルト品質向上に向けた協同組合アップグレードプログラム、日本の発酵食品の全国的な推進などの要因により、2031年までに5.74%のCAGRで成長すると予測されています。2024年には、中国が12の新しい国内菌株を承認し、欧米からの輸入への依存を減らし、サプライチェーンを現地化しました。一方、インドは、現在生産量の15%を超える腐敗損失に対処するため、乳製品協同組合に培養投与設備を供給する5000万米ドルのイニシアチブを開始しました。
* 北米は、FDAの生体治療薬ガイダンスに支えられたイノベーションに焦点を当てた高価値市場であり、処方箋プロバイオティクスへの道を開いています。
* ブラジルでは、家禽部門が抗生物質不使用の輸出を支援するために酵母ベースのプロバイオティクスの使用を拡大しています。中東では、サウジアラビアのビジョン2030乳製品投資が微生物培養の需要を牽引しています。これらの地域での成長は、コールドチェーンの制限に対処するために、GMPグレードの培養と常温安定性のある形式を提供できるサプライヤーにかかっています。

競争環境

微生物培養市場は中程度の集中度を示しており、グローバルリーダーは規模のメリットを享受しつつ、ニッチなプレーヤーが革新する機会を残しています。2024年にChr. HansenとNovozymesの合併により設立されたNovonesisは、酵素、培養、カーボンネガティブエタノール経路にわたる事業を展開し、顧客のベンダー依存を減らし、再処方プロセスを迅速化するバンドルソリューションを提供しています。技術は依然として重要な差別化要因です。LallemandやKerryのようなサプライヤーは、凍結濃縮物と比較して生産コストが60%～80%増加するにもかかわらず、凍結乾燥およびマイクロカプセル化された形式により、コールドチェーンインフラが脆弱な輸出市場にアクセスしています。

特許出願は、研究開発の優先順位が異なることを示しており、例えばNovonesisはバイオプロテクションのためのバクテリオシン産生菌株に焦点を当てている一方、IFFは植物性乳製品用途に特化した多菌株コンソーシアムに投資しています。Biena BioTechやMediterranea Biotechnologieのような小規模な競合他社は、EUの有機基準を満たす非遺伝子組み換え、アレルゲンフリーの培養を提供することで市場シェアを獲得しています。デジタル菌株スクリーニングツール、AI駆動型発酵、医薬品顧客向けのGMPアップグレードなどの進歩は、グローバルリーダーと地域プレーヤー間の能力ギャップを拡大しています。

しかし、メタノールや合成ガス原料向けの精密発酵共培養や、処方箋プロバイオティクス向けの生体治療培養供給などの分野には市場機会が残されています。検証済みの菌株ライブラリ、堅牢なコンプライアンスインフラ、およびスケーラブルな生産能力を持つサプライヤーは、今後5年間で市場シェアを加速的に成長させる有利な立場にあります。

最近の業界動向

* 2025年9月： dsm-firmenichは、半硬質、硬質、およびコンチネンタルチーズ向けの次世代オールインワン培養ソリューション「Dairy Safe」を発表しました。これらの培養は、腐敗やファージ汚染に対するバイオプロテクションを提供し、一貫した酸性化を確保し、アイ形成を制御し、風味を高めることで、人工保存料なしで高品質でクリーンラベルのチーズ生産を可能にします。
* 2025年2月： アサヒグループ食品は、ADM Wild Valenciaと提携し、独自のLactobacillus gasseri CP2305菌株を北米、欧州、アジアで国際的に流通させることを発表しました。この乳酸菌は、これまでアサヒ独自の製品にのみ使用されていましたが、今後は機能性微生物成分として世界のメーカーが利用できるようになり、発酵食品、飲料、その他の微生物培養用途の成長を促進します。
* 2024年2月： Lallemand Specialty Culturesは、2つの新しい乳製品培養を導入しました。Flav-Antage BLB1は、ウォッシュドチーズやスメアードチーズの自然な皮の色と香りを高めるために設計され、Flav-Antage LN2は、ブルーチーズのカードの開口部を改善し、均一なカビの成長を確保するために開発されました。これらの性能重視の培養は、クリーンラベルで一貫した感覚特性をサポートし、微生物培養の用途を伝統的な発酵を超えて拡大し、世界中の特殊乳製品の成長を牽引しています。

このレポートは、世界の微生物培養市場に関する包括的な分析を提供しています。微生物培養は、スターター培養、アジャンクト・アロマ培養、プロバイオティクスといった幅広い製品群を含み、ベーカリー・菓子、乳製品、果物・野菜、飲料といった食品・飲料産業から、その他の多様な最終用途産業に至るまで、広範な応用分野を持っています。本レポートでは、北米、欧州、アジア太平洋、南米、中東・アフリカといった主要地域における市場の現状と将来の展望を詳細に調査しています。

市場の全体像として、世界の微生物培養市場は堅調な成長を続けており、2026年には23.2億米ドルの市場規模に達すると推定されています。さらに、2031年までには28.6億米ドルにまで拡大すると予測されており、その成長は多岐にわたる要因によって支えられています。

市場の成長を促進する主要な要因は以下の通りです。
第一に、健康志向の高まりとともに、プロバイオティクスが豊富な機能性食品への需要が世界的に増加しています。これは、腸内環境の改善や免疫力向上への関心が高まっていることを反映しています。
第二に、バイオ医薬品産業における発酵能力の継続的な拡大が挙げられます。微生物培養は、ワクチン、酵素、その他の生物学的製剤の生産に不可欠であり、この分野の成長が市場を牽引しています。
第三に、食品・飲料業界では、人工添加物を避け、より自然で健康的な製品を求める消費者の傾向が強まっており、クリーンラベルの天然保存料への移行が進んでいます。微生物培養由来の保存料は、この需要に応えるものとして注目されています。
第四に、持続可能な食料生産への関心が高まる中で、代替タンパク質製造のための精密発酵技術の急速な採用が進んでいます。これにより、微生物培養の新たな応用分野が拡大しています。
第五に、気候変動対策の一環として、カーボンネガティブなバイオプロセシングに対する政府や国際機関からのインセンティブが増加しており、これが微生物培養技術の開発と導入を後押ししています。
最後に、農業および動物飼料分野においても、家畜の健康増進や飼料効率の改善を目的とした微生物培養の採用が着実に増加しています。

一方で、市場の成長にはいくつかの課題も存在します。
最も顕著なのは、微生物培養製品に対する厳格な規制承認プロセスです。特に新規製品や用途においては、安全性と有効性の証明に時間とコストがかかります。
また、培地用原材料の供給における変動性も懸念事項です。原材料価格の不安定さや供給途絶のリスクは、生産コストや安定供給に影響を与える可能性があります。
さらに、微生物培養の生産プロセスにおいては、バッチ汚染のリスクが常に存在し、これが製品リコールにつながる可能性をはらんでいます。品質管理の徹底が不可欠です。
最後に、多くの微生物培養製品は、その品質を維持するために高いコールドチェーン（低温物流）への依存を必要とします。これにより、物流の複雑性が増し、輸送および保管コストが高騰する傾向にあります。

製品タイプ別に見ると、市場は細菌培養（乳酸菌、プロピオン酸菌、その他の細菌を含む）、酵母培養、カビ/真菌培養、および混合/複合培養に細分化されています。この中で、酵母培養は、ベーカリー製品の需要増加やバイオエタノール生産の拡大に牽引され、年間平均成長率（CAGR）6.74%で最も高い成長率を示すと予測されています。

アプリケーション別では、食品・飲料分野（乳製品、食肉・家禽・魚介類、飲料、その他）、栄養補助食品・医薬品分野、そしてその他（動物飼料・ペット栄養、農業）に分類されます。特に栄養補助食品・医薬品セグメントは、健康意識の高まりと医療分野での応用拡大により、CAGR 7.29%という最も急速な拡大が見込まれています。

地域別分析では、欧州が2025年に世界の収益の31.65%を占めるなど、微生物培養市場において引き続き重要な役割を担っています。北米市場も米国、カナダ、メキシコを中心に大きな存在感を示しています。アジア太平洋地域では、中国、日本、インド、韓国、オーストラリアが主要な市場として成長を牽引しており、特に新興国における需要の増加が期待されます。南米および中東・アフリカ地域も、今後の成長が注目される市場です。

競争環境においては、Novonesis A/S、dsm-firmenich、International Flavors & Fragrances Inc.、Lallemand Inc.、Kerry Group plcなど、世界的に著名な多数の企業が市場で活発に事業を展開しています。レポートでは、これらの主要企業のグローバルおよび市場レベルの概要、中核セグメント、財務状況（入手可能な場合）、戦略的情報、市場ランク/シェア、製品とサービス、および最近の動向について詳細なプロファイルが提供されています。

本レポートは、これらの分析を通じて、微生物培養市場における現在の機会と将来の展望を明確に示しており、市場参加者にとって貴重な洞察を提供するものとなっています。

1. はじめに

• 1.1 調査の前提条件と市場の定義

• 1.2 調査範囲

2. 調査方法

3. エグゼクティブサマリー

4. 市場概況

• 4.1 市場概要

• 4.2 市場の推進要因
  • 4.2.1 プロバイオティクスが豊富な機能性食品の需要増加

  • 4.2.2 産業用バイオ医薬品発酵能力の拡大

  • 4.2.3 食品・飲料業界におけるクリーンラベルの天然保存料への移行

  • 4.2.4 代替タンパク質のための精密発酵の急速な採用

  • 4.2.5 気候政策におけるカーボンネガティブなバイオプロセシングのインセンティブ

  • 4.2.6 農業および動物飼料における採用の増加

• 4.3 市場の阻害要因
  • 4.3.1 厳格な規制承認

  • 4.3.2 培地用原材料供給の変動性

  • 4.3.3 バッチ汚染および製品リコールの高いリスク

  • 4.3.4 高いコールドチェーン依存が物流の複雑さとコストを増加させる

• 4.4 サプライチェーン分析

• 4.5 規制および技術的展望

• 4.6 ポーターの5つの力分析
  • 4.6.1 新規参入の脅威

  • 4.6.2 買い手の交渉力

  • 4.6.3 供給者の交渉力

  • 4.6.4 代替品の脅威

  • 4.6.5 競争の激しさ

5. 市場規模と成長予測（金額）

• 5.1 製品タイプ別
  • 5.1.1 細菌培養

  • 5.1.1.1 乳酸菌

  • 5.1.1.2 プロピオン酸菌

  • 5.1.1.3 その他の細菌

  • 5.1.2 酵母培養

  • 5.1.3 カビ/真菌培養

  • 5.1.4 混合/複合培養

• 5.2 用途別
  • 5.2.1 食品および飲料

  • 5.2.1.1 乳製品および乳製品

  • 5.2.1.2 肉、家禽、魚介類

  • 5.2.1.3 飲料

  • 5.2.1.4 その他

  • 5.2.2 栄養補助食品および医薬品

  • 5.2.3 その他（動物飼料およびペット栄養、農業）

• 5.3 地域別
  • 5.3.1 北米

  • 5.3.1.1 米国

  • 5.3.1.2 カナダ

  • 5.3.1.3 メキシコ

  • 5.3.1.4 その他の北米

  • 5.3.2 ヨーロッパ

  • 5.3.2.1 ドイツ

  • 5.3.2.2 イギリス

  • 5.3.2.3 フランス

  • 5.3.2.4 イタリア

  • 5.3.2.5 スペイン

  • 5.3.2.6 その他のヨーロッパ

  • 5.3.3 アジア太平洋

  • 5.3.3.1 中国

  • 5.3.3.2 日本

  • 5.3.3.3 インド

  • 5.3.3.4 韓国

  • 5.3.3.5 オーストラリア

  • 5.3.3.6 その他のアジア太平洋

  • 5.3.4 南米

  • 5.3.4.1 ブラジル

  • 5.3.4.2 アルゼンチン

  • 5.3.4.3 その他の南米

  • 5.3.5 中東およびアフリカ

  • 5.3.5.1 サウジアラビア

  • 5.3.5.2 アラブ首長国連邦

  • 5.3.5.3 南アフリカ

  • 5.3.5.4 その他の中東およびアフリカ

6. 競合情勢

• 6.1 最も活発な企業

• 6.2 市場ポジショニング分析

• 6.3 企業プロファイル {(グローバルレベルの概要、市場レベルの概要、主要セグメント、利用可能な財務情報、戦略情報、主要企業の市場ランク/シェア、製品とサービス、および最近の動向を含む)}
  • 6.3.1 Novonesis A/S

  • 6.3.2 dsm-firmenich

  • 6.3.3 International Flavors & Fragrances Inc.

  • 6.3.4 Lallemand Inc.

  • 6.3.5 Kerry Group plc

  • 6.3.6 Bioprox

  • 6.3.7 HiMedia Laboratories

  • 6.3.8 Biena BioTech GmbH

  • 6.3.9 CSK Food Enrichment BV

  • 6.3.10 Mediterranea Biotechnologie s.r.l.

  • 6.3.11 Angel Yeast Co., Ltd.

  • 6.3.12 AB Mauri

  • 6.3.13 Lesaffre

  • 6.3.14 Sacco System

  • 6.3.15 Novozymes A/S

  • 6.3.16 Tate & Lyle PLC

  • 6.3.17 BioGaia AB

  • 6.3.18 Probi AB

  • 6.3.19 Ganeden

  • 6.3.20 JiangSu Wecare BioTech

7. 市場機会と将来の見通し