市場調査レポート

フラグメントベース創薬 市場規模と展望 2025年~2033年

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**フラグメントベース創薬市場の包括的分析レポート**

**市場概要**

世界のフラグメントベース創薬市場は、2024年に8億6,930万米ドルの規模に達しました。この市場は、2025年には9億3,929万米ドルに成長し、2033年までには目覚ましい成長を遂げ、26億8,594万米ドルに達すると予測されています。この予測期間(2025年~2033年)における年平均成長率(CAGR)は11.5%と見込まれており、フラグメントベース創薬(FBDD)アプローチの医薬品開発における重要性が増していることを明確に示しています。

フラグメントベース創薬は、標的に対して比較的弱い結合を示す小さな分子断片(フラグメント)を出発点として、強力な低分子化合物へと発展させる革新的な手法です。このアプローチは、従来のハイスループットスクリーニング(HTS)キャンペーンと比較して、いくつかの顕著な利点を提供します。具体的には、実験コストの削減、多様なヒット化合物の発見、そして新規化合物を開発するための多角的な道筋を提供できる点です。FBDDは、酵素、タンパク質間相互作用(PPI)、膜タンパク質といった多様な標的に対して応用されてきました。

フラグメントベース創薬のプロセスは、一般的に以下の主要なステップで構成されます。まず、ターゲットとする疾患や経路に関連するタンパク質に結合する可能性のある、化学的に多様な小分子フラグメントのライブラリを選定します。次に、X線結晶構造解析、核磁気共鳴(NMR)、表面プラズモン共鳴(SPR)などの高感度な生物物理学的手法を用いて、これらのフラグメントが標的タンパク質に結合するかどうかをスクリーニングし、初期の「ヒット」フラグメントを特定します。その後、フラグメントと標的タンパク質の複合体構造を原子レベルで詳細に解明し、結合様式を理解します。この構造情報に基づき、構造活性相関(SAR)を分析するためのアッセイを開発し、結合親和性や選択性を向上させるための化学的修飾の指針とします。最終的に、これらのフラグメントを「成長」させるか、または複数のフラグメントを「連結」させる戦略を設計し、より強力で薬物特性に優れたリード化合物へと発展させます。

このように、フラグメントベース創薬は標的指向型創薬において広く採用されるアプローチとなり、これまでに複数の承認薬や臨床候補薬の発見に貢献し、医薬品開発のパラダイムを大きく変えつつあります。その成長は、医薬品開発の効率化と新規治療薬への切迫したニーズに応える能力に裏打ちされています。

**促進要因(ドライバー)**

フラグメントベース創薬市場の成長を牽引する主要な促進要因は多岐にわたります。

第一に、構造生物学技術の飛躍的な進歩が挙げられます。X線結晶構造解析、NMR分光法、クライオ電子顕微鏡(Cryo-EM)といった技術の解像度と効率が向上したことで、フラグメントと標的タンパク質との結合様式をより迅速かつ正確に特定できるようになりました。これにより、初期の弱い結合から出発して、合理的かつ効率的にリード化合物を最適化するプロセスが加速されています。例えば、これらの技術は、フラグメントがタンパク質の特定のポケットにどのように結合し、どのような相互作用を持つかを原子レベルで可視化することを可能にし、薬剤設計者がより適切な化学的修飾を行うための貴重な情報を提供します。

第二に、新規かつ効果的な治療薬に対する需要の増加が市場を押し上げています。世界人口の高齢化、生活習慣病の増加、そして既存薬に対する薬剤耐性の出現などにより、新たな作用機序を持つ革新的な医薬品の開発が喫緊の課題となっています。フラグメントベース創薬は、これまでの創薬手法では困難であった標的にもアプローチできる可能性を秘めており、この需要に応える強力な手段として期待されています。

第三に、慢性疾患の有病率の上昇が、フラグメントベース創薬の採用を促進しています。がん、中枢神経系疾患、感染症、心血管疾患、代謝性疾患、炎症性疾患、自己免疫疾患といった幅広い治療領域において、FBDDの応用が拡大しています。これらの複雑で満たされていない医療ニーズに対して、FBDDは新規かつ効果的な薬剤を発見する可能性を秘めています。その柔軟性と汎用性の高い戦略は、多様な疾患や病態に対する医薬品開発を加速する有望なアプローチとして位置づけられています。

フラグメントベース創薬市場の企業は、この機会を最大限に活用するために、様々な戦略を展開しています。これには、異なる治療標的に対するFBDD手法の開発と応用、学術機関や研究機関との積極的な協力関係の構築、そしてフラグメントの効率的なスクリーニングと最適化を可能にする生物物理学的手法や技術への継続的な投資が含まれます。これらの取り組みは、市場の持続的な成長をさらに促進すると考えられます。

**抑制要因(リステイント)**

フラグメントベース創薬市場の成長には、いくつかの固有の課題と抑制要因も存在します。

最も主要な抑制要因は、フラグメントが従来の薬物様化合物と比較して、原子数や結合が少ない小さな分子であるという点です。この本質的な特性は、フラグメントの構造的複雑性と多様性を制限します。結果として、フラグメントがカバーできる化学空間の範囲が限定されることになります。これは、標的タンパク質の表面にある重要な領域の一部が、初期のフラグメントによって認識されにくい、あるいはアクセスできない可能性があることを意味します。この制約は、新規で強力な阻害剤を発見する機会を逸することにつながる可能性があります。

さらに、化学的多様性の限定は、フラグメントを容易に「成長」させたり「連結」させたりして、より大きく複雑な分子を形成する可能性を低下させることにもつながります。フラグメントベース創薬プロセスにおいて、この「成長」または「連結」は、薬物様リード化合物を開発するための極めて重要なステップです。初期フラグメントの構造が単純すぎると、その後の最適化の段階で、目的の結合親和性、選択性、薬物動態学的特性(ADME特性)を達成することが困難になる場合があります。また、フラグメントを大きくする過程で、分子量が増加し、溶解性や膜透過性などの物理化学的特性が悪化するリスクも伴います。これらの課題は、フラグメントから臨床的に有用な薬剤を開発するまでの道のりを複雑にし、時間とコストを増加させる要因となり得ます。

**機会(オポチュニティ)**

フラグメントベース創薬市場にとって、特に大きな機会となるのは、希少疾病および顧みられない病気への焦点です。これらの疾患は世界中で数百万人の人々に影響を与えているにもかかわらず、効果的な治療法が限られているか、全く存在しないことが少なくありません。フラグメントベース創薬は、これらの疾患に対する新規薬剤を発見するための革新的かつ効率的な方法を提供することができます。

FBDDの強みは、タンパク質間相互作用(PPI)、アロステリック部位、膜タンパク質といった、従来の創薬手法では標的化が困難であった未開拓のタンパク質クラスにもアプローチできる点にあります。これらの「難攻不落」な標的は、希少疾患や顧みられない病気の多くにおいて重要な役割を果たすことが知られています。フラグメントは小さく、比較的単純な構造であるため、タンパク質の深いポケットや柔軟な領域にも適合しやすく、従来のスクリーニングでは見逃されがちな結合部位を発見する可能性を秘めています。

さらに、天然物由来のフラグメントの利用も大きな機会です。天然物は、多様で複雑な化学構造を持つフラグメントの豊かな源であり、希少疾病や顧みられない病気に関連する生物学的標的を調節する可能性を秘めています。天然物ライブラリから得られるフラグメントは、合成化合物では得られないようなユニークな構造と機能を提供し、創薬の出発点として新たな道を開くことができます。

したがって、希少疾病および顧みられない病気に焦点を当てることは、FBDD市場にとって、これらの人々の満たされていない医療ニーズに対応し、革新的で効果的な治療法を創出する絶好の機会となります。フラグメントベース創薬市場の企業は、この機会を活かすために、新しい標的や経路の探索、これらの疾患に対する医薬品開発を支援する公的・私的機関との提携、そして天然物をフラグメントライブラリとして活用したスクリーニングと最適化に注力することができます。

具体的な例として、米国国立衛生研究所(NIH)の国立トランスレーショナル科学推進センター(NCATS)の一部である「希少および顧みられない病気のための治療法(TRND)プログラム」が挙げられます。TRNDプログラムは、前臨床試験、規制に関するガイダンス、臨床試験デザインなどの科学的および運営的支援を提供することで、希少疾病および顧みられない病気のための医薬品開発を促進することを目的としています。このプログラムは、学術研究者、バイオテクノロジー企業、患者支援団体と協力し、有望な医薬品候補を開発パイプラインを通じて推進しています。このような公的支援プログラムは、FBDD市場の成長に有利な環境を創出します。

また、米国食品医薬品局(FDA)が提供する希少疾病および顧みられない病気に対するインセンティブとプログラムも、市場の機会を拡大しています。これらのプログラムは、しばしば効果的な治療法が限られているか存在しないこれらの病態に対する医薬品開発を促進し、加速するために設計されています。FDAは、オーファンドラッグ指定、ファストトラック指定、優先審査指定、画期的治療薬指定、希少小児疾患指定、オーファン製品助成プログラム、希少神経変性疾患助成プログラムなど、様々なインセンティブを提供しています。これらの指定やプログラムは、税額控除、申請料免除、市場独占権、優先審査、迅速承認、臨床試験や自然史研究への資金提供、効率的な医薬品開発に関するガイダンスなどの恩恵をもたらします。FDAはこれらのインセンティブとプログラムを通じて、希少疾病および顧みられない病気の患者の健康と生活の質を向上させ、満たされていない医療ニーズに対応することを目指しています。

さらに、フラグメントベース創薬の成功事例は、市場の可能性を強く裏付けています。例えば、アムジェン社、アステックス・ファーマシューティカルズ社、カリフォルニア大学サンフランシスコ校の研究チームによって発見された、複数のがん種を駆動する変異タンパク質であるKRAS G12Cの新規阻害剤「AMG 510」の開発は特筆に値します。AMG 510は、フラグメントスクリーニング、構造ベース設計、医薬品化学最適化の組み合わせによって特定されました。AMG 510は、KRAS G12Cに対する初の共有結合性阻害剤として臨床試験に入り、非小細胞肺がんおよび大腸がんの患者において有望な結果を示しています。この成功は、フラグメントベース創薬が、これまで「創薬不能」とされてきた標的にも有効な治療薬を開発できることを実証し、市場全体の信頼性と魅力を高めています。

**セグメント分析**

**1. 地域分析**

* **北米地域:**
北米は、世界のフラグメントベース創薬市場において最も大きなシェアを占めており、予測期間中に大幅な拡大が期待されています。この優位性は、多様な治療領域(中枢神経系疾患、腫瘍、感染症など)において医薬品の発見と開発に積極的に関与している多数のバイオ医薬品企業の存在に起因しています。これらの企業は、従来のハイスループットスクリーニングや構造ベース創薬といった手法を補完または代替するアプローチとして、フラグメントベース創薬を活用し、新規かつ強力なリード化合物の特定に努めています。

また、北米には、業界のプレーヤーと連携し、フラグメントスクリーニングおよび最適化サービスを提供する学術機関や研究機関が強く存在します。これらの機関は、X線結晶構造解析、核磁気共鳴(NMR)、表面プラズモン共鳴(SPR)など、フラグメントと標的の相互作用を効率的かつ正確に検出・特性評価できる高度な生物物理学的手法と技術へのアクセスを有しています。これにより、研究開発の効率性が大幅に向上しています。

さらに、FDAが提供する希少疾病および顧みられない病気に対するインセンティブとプログラムは、これらの病態に対する医薬品開発を促進し、加速するために設計されており、北米市場の成長を後押ししています。前述のKRAS G12C阻害剤AMG 510の発見も、北米の企業と研究機関が連携して達成したフラグメントベース創薬の顕著な成功事例であり、この地域の技術力とイノベーション能力を象徴しています。

* **アジア太平洋地域:**
アジア太平洋地域は、予測期間中に著しい成長を遂げると予測されています。この成長の背景には、いくつかの重要な要因があります。まず、増加する人口は、様々な疾患や病態に対する新規かつ効果的な薬剤への需要を高めています。また、結核、マラリア、糖尿病、がんといった感染症や慢性疾患の有病率が高いことも、革新的な治療法の必要性を増大させています。

この地域は、新規医薬品の承認と商業化を支援する好ましい規制環境を整備しつつあります。例えば、中国は医薬品の審査・承認プロセスを迅速化するための改革を実施しており、外国の臨床試験データの受け入れや、革新的な医薬品に対する優先審査の付与などが含まれます。これにより、革新的なフラグメントベース創薬の成果が市場に投入されるまでの時間が短縮され、投資が促進されています。

さらに、アジア太平洋地域は、医薬品の発見と開発コストが比較的低いという利点も持っており、これが海外からの投資や共同研究を引き付けています。例えば、インドは、高度なスキルと資格を持つ科学者、エンジニア、技術者の豊富な人材プールを擁しており、フラグメントベース創薬において高品質かつ費用対効果の高いサービスを提供しています。これらの要因が複合的に作用し、アジア太平洋地域のフラグメントベース創薬市場は急速に拡大すると見込まれています。

**2. サービスコンポーネントセグメント**

* **フラグメント最適化:**
フラグメントベース創薬市場において、サービスコンポーネントセグメントでは「フラグメント最適化」が最も支配的な地位を占めています。これは、初期のフラグメントヒットの結合親和性、選択性、および物理化学的特性を改善するプロセスであるため、創薬の成功に不可欠なステップだからです。フラグメント最適化は、弱く、薬物らしくない初期フラグメントを、強力で薬物特性に優れたリード化合物へと変換するための極めて重要な段階です。

このプロセスには、様々な生物物理学的手法(例:SAR by NMR、X線共結晶構造解析)、計算化学的手法(例:分子ドッキング、分子動力学シミュレーション)、および医薬品化学の原則の応用が不可欠です。これらの技術を駆使して、フラグメントの化学構造を段階的に修飾し、標的タンパク質との相互作用を強化しつつ、オフターゲット効果を最小限に抑え、溶解性、安定性、膜透過性といった薬物動態学的特性を最適化します。フラグメント最適化は、新規かつ効果的な薬剤の開発において、非常に価値があり効率的なサービスを提供するため、市場におけるその優位性は揺るぎません。この段階での成功が、開発パイプラインにおける最終的な薬剤候補の品質と成功確率を大きく左右します。

**3. エンドユーザーセグメント**

* **バイオ医薬品企業:**
エンドユーザーセグメントにおいて、バイオ医薬品企業がフラグメントベース創薬市場の支配的なセグメントとなっています。これは、腫瘍、中枢神経系疾患、感染症、心血管疾患、代謝性疾患、炎症性疾患、自己免疫疾患など、様々な治療領域における新規かつ効果的な薬剤に対する需要が絶えず増加しているためです。

フラグメントベース創薬は、バイオ医薬品企業にとっていくつかの重要な利点を提供します。具体的には、医薬品開発のコストと時間の削減、新たな化学空間と結合様式の探索、従来の創薬手法では困難であったタンパク質クラス(例:タンパク質間相互作用、膜タンパク質)の標的化、そしてリード化合物の効力と選択性の向上などが挙げられます。これらの利点により、バイオ医薬品企業は、自社の医薬品開発パイプラインのためのリード化合物を特定し、最適化するために、フラグメントベース創薬アプローチを積極的に採用しています。結果として、バイオ医薬品企業はフラグメントベース創薬サービスの主要な消費者となっており、市場成長の強力な推進力となっています。

**4. 治療分野セグメント**

* **腫瘍(オンコロジー):**
フラグメントベース創薬市場において、腫瘍分野は最も支配的な治療分野セグメントの一つです。これは、がんが満たされていない医療ニーズが非常に高く、かつ膨大な患者人口を抱える主要な治療領域であるためです。がんはその複雑性と多様性から、常に新しい治療法の開発が求められており、フラグメントベース創薬はこれに応える革新的かつ効率的な方法を提供します。

FBDDは、タンパク質間相互作用(PPI)、アロステリック部位、膜タンパク質など、これまで標的化が困難であった未開拓のタンパク質クラスにもアプローチできるため、がんに対する新規薬剤を発見する上で特に有望です。例えば、がんの増殖や転移に関わる多くのタンパク質は、明確な結合ポケットを持たず、従来の低分子薬剤では標的化が難しいとされてきました。しかし、フラグメントベース創薬は、これらのタンパク質の小さな結合部位や、立体構造変化を誘発するアロステリック部位を特定し、そこから薬物へと発展させることが可能です。

さらに、フラグメントベース創薬は、医薬品開発のコストと時間を削減できるという利点も持ち合わせており、これはがん治療薬の開発における主要な障壁の一つを克服する上で極めて重要です。また、天然物は、腫瘍学に関連する生物学的標的を調節できる多様で複雑なフラグメントの豊富な源であり、FBDDはこれらの天然物由来フラグメントの利用からも恩恵を受けることができます。これらの要因が複合的に作用し、腫瘍分野はフラグメントベース創薬市場において最も活発で成長性の高いセグメントとなっています。


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Report Coverage & Structure

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      • コロンビア
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    • 競合状況
      • フラグメントベース創薬市場のプレイヤー別シェア
      • M&A契約と提携分析
    • 市場プレイヤー評価
      • ファイザー株式会社
        • 概要
        • 事業情報
        • 収益
        • 平均販売価格 (ASP)
        • SWOT分析
        • 最近の動向
      • ノバルティスAG
      • ジョンソン・エンド・ジョンソン
      • アルベウス・ファーマシューティカルズ株式会社
      • アステックス・ファーマシューティカルズ
      • チャールズ・リバー・ラボラトリーズ・インターナショナル株式会社
      • ベアティカAB
      • エメラルド・バイオストラクチャーズ株式会社
      • クラウン・バイオサイエンス株式会社
      • エボテックAG
      • プロテロス・フラグメンツGmbH
      • キネティック・ディスカバリー・リミテッド
      • スプリント・バイオサイエンス
      • シグネチャー・ディスカバリー
      • ストラクチャー・ベースド・デザイン株式会社
    • 調査方法
      • 調査データ
        • 二次データ
        • 主要な二次情報源
        • 二次情報源からの主要データ
      • 一次データ
        • 一次情報源からの主要データ
        • 一次情報の内訳
      • 二次および一次調査
        • 主要な業界インサイト
      • 市場規模推定
        • ボトムアップアプローチ
        • トップダウンアプローチ
        • 市場予測
      • 調査仮定
        • 仮定
      • 制限事項
      • リスク評価
    • 付録
      • 議論ガイド
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グローバル市場調査レポート販売と委託調査

[参考情報]
フラグメントベース創薬とは、医薬品候補化合物の探索において、非常に小さな分子断片(フラグメント)を出発点とする革新的なアプローチでございます。従来のハイスループットスクリーニング(HTS)が比較的大きな分子ライブラリから高い親和性を持つ化合物を直接探索するのに対し、フラグメントベース創薬では、タンパク質標的へ比較的弱いながらも特異的に結合するフラグメントを見つけ出し、それを足がかりとしてより強力で薬らしい化合物へと発展させていく手法が特徴的です。このアプローチは、化学空間をより効率的に探索し、より高いヒット率を実現する可能性を秘めており、初期段階でリガンド効率の高い分子を得やすいという利点がございます。

フラグメントの同定には、主に様々な物理化学的手法が用いられます。例えば、核磁気共鳴(NMR)分光法は、溶液中でフラグメントと標的タンパク質の相互作用を詳細に解析し、結合部位や結合様式に関する情報を提供します。また、X線結晶構造解析は、フラグメントが結合したタンパク質の立体構造を原子レベルで明らかにし、結合様式を視覚的に捉えることを可能にします。その他にも、表面プラズモン共鳴(SPR)や等温滴定カロリメトリー(ITC)などのバイオ物理学的スクリーニング法が、フラグメントの結合親和性や熱力学的パラメーターを測定するために広く利用されており、微小熱泳動(MST)や示差走査熱量測定(DSF)などもスクリーニングに活用されます。これらの手法は、フラグメントの弱い結合を検出するのに適しているため、初期スクリーニングにおいて機能アッセイよりも優位性を持つことが少なくありません。

一度フラグメントが同定されると、それらをより強力な薬候補へと発展させるための戦略がいくつか存在します。一つは「フラグメントグローイング(成長)」と呼ばれる手法で、標的タンパク質に結合しているフラグメントの骨格を維持しつつ、結合部位の空隙を埋めるように化学構造を段階的に拡張していく方法です。もう一つは「フラグメントリンキング(連結)」で、タンパク質上の異なるが近接した部位に結合する複数のフラグメントを見つけ出し、それらを適切なリンカーで連結して一つの大きな分子とするアプローチです。さらに、「フラグメントマージング(融合)」という手法もあり、これは二つのフラグメントが持つ有効な特徴を一つの分子に統合することで、より効率的な結合を実現するものです。これらの発展戦略は、得られた構造情報に基づいて合理的に設計され、化合物の親和性や選択性を向上させます。

フラグメントベース創薬は、幅広い疾患領域における医薬品開発に応用されています。特に、既存のスクリーニング手法では困難であった、タンパク質間相互作用(PPI)阻害剤や、酵素の新しいアロステリック部位を標的とする薬剤、さらにはGタンパク質共役型受容体(GPCR)などの複雑な膜タンパク質を標的とする創薬においても、その有効性が示され始めています。従来のHTSではヒット化合物が得られにくい「難治性標的」に対しても、フラグメントベース創薬は新たなリード化合物を見出す強力な手段となり得ます。また、リード化合物の最適化段階においても、フラグメントの知見を活用することで、薬物動態や毒性プロファイルを改善し、より優れた候補化合物へと導くことが期待されます。

この創薬アプローチを支える関連技術は多岐にわたります。まず、前述のX線結晶構造解析やNMR分光法といった構造生物学的手法は、フラグメントの結合様式やタンパク質のコンフォメーション変化を詳細に解明し、合理的な分子設計の基盤を提供します。近年では、より大きな複合体や柔軟なタンパク質に対しても適用可能なクライオ電子顕微鏡(Cryo-EM)も、その有用性が高まっています。計算化学も重要な役割を果たし、分子ドッキングや分子動力学シミュレーションによってフラグメントの結合予測や相互作用の解析が行われ、バーチャルスクリーニングによって有望なフラグメントを絞り込むことも可能です。さらに、構造情報を基にしたデノボデザインによって、新たな化学構造の提案も行われます。

合成化学も不可欠な要素であり、フラグメントライブラリの構築や、ヒットフラグメントの構造展開には、多様な合成反応やパラレル合成、コンビナトリアルケミストリーの技術が活用されます。医薬化学の知識は、フラグメントから発展させた分子が優れた薬物動態(ADME)特性や安全性プロファイルを持つように最適化する上で極めて重要です。また、ハイスループットなバイオ物理学的スクリーニング技術の進化も、多数のフラグメントを効率的に評価するために貢献しています。このように、フラグメントベース創薬は、構造生物学、計算科学、合成化学、そしてバイオ物理学といった多様な専門分野の知見と技術が融合することで初めてその真価を発揮し、現代の医薬品開発において重要な柱の一つとなっているのでございます。